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首頁 > 商務會議 > 教育培訓會議 > 多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年 更新時間:2023-12-11T11:51:54

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年
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多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

會議時間:2024-02-23 09:00至 2024-02-25 18:00結束

會議地點: 線上活動  詳細地址會前通知  

會議規模:暫無

主辦單位: 上海統循會務咨詢有限公司

發票類型:增值稅普通發票 增值稅專用發票

門票名稱單價截止時間數量
會務費 暫無說明 ¥3200.0 2024-02-22 17:00

會議介紹

會議內容 主辦方介紹


多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年宣傳圖

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會

2024223-25 騰訊會議網絡會議室

背景介紹

2019年度國家自然基金醫學科學部共批資助10138項目,批助金額總計441310萬元。這些項目中大部分都與編碼基因有直接或間接的關聯。其中,與通路(pathway)關聯的有1349項,金額4.89億;與miRNA相關的有630項,金額2.3億;與lncRNA相關的有395項,金額1.45億,與甲基化相關的有213項,金額8748萬,與突變相關的有190項,金額7410萬;

如何獲得有創新意義的疾病靶標基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是項目申請及文章寫作時最常見的問題。

目前,多組學整合分析是一個非常熱門且創新的方向。通過多組學整合分析我們可以更加快速、準確的找到與研究方向關聯的biomarks。它的核心原理是期望通過高通量數據,找到所有基因在不同組學水平中的變化并進行分析,獲得關鍵基因在各個組學都有顯著作用。

多組學整合分析的原始數據來源有兩種:(1)自己采集樣本做高通量測序/芯片/質譜等;(2)使用公共數據庫中的組學數據(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。

那么我們即便有了非常好的數據,又該怎么辦呢?

用什么方法,什么工具?可以獲得哪些結果,生成哪些圖片呢?


基于這個目的,我們開展了該培訓班。通過三天的學習,我們了解多組學整合分析思路對項目及文章的幫助,以及實操常見的數據庫、在線工具和本地軟件。使得學員可以自己完成一個完整的分析報告并獲得疾病相關的靶標基因。

主要內容詳細內容見下文日程表

  1. 多組學分析常用數據庫;
  2. 多組學分析常用軟件和工具;
  3. 教授對應的圖片制作方法(包含但不限于聚類熱圖、火山圖、富集分析圖、Venn圖、pathwaymap

【會議預期】

通過兩天兩晚的學習,了解多組學整合分析思路對項目及文章的幫助,以及實操常見的數據庫、在線工具和本地軟件。使得學員可以自己完成一個完整的分析報告并獲得疾病相關的靶標基因。

講師簡介

宋偉博士

成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創唐篩流程的開發。

研究方向:有近十年的生信分析經驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

培訓經歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓班。



主辦方:上海統循會務咨詢有限公司

會議時間20242月23-25

會議地點線上:騰訊會議網絡會議室

通過騰訊會議直播

收費標準:會務費:線上:3200/人;

優惠政策:

1.提前確認報名及轉賬的,可以提前拿到學習材料

2.三人組團報名,每人優惠100元

3.四人組團報名,每人優惠200元,

4.人組團報名繳費,可免1人會務費!

可以開正規會務發票,紙質邀請函(蓋紅章)。

注意事項:必須攜帶win10以上系統的電腦,現場不得錄音錄像。上課軟件為Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

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會議日程

時間安排

課程表

介紹

第一天晚上

19:00~21:00

1節:組學簡介及生信概述

近年國自然中組學相關項目解讀

組學原始數據的來源及質量判斷

高通量:測序及芯片介紹——不同組學:轉錄組學、基因組學、表觀組學、順反組學、宏基因組學等。

文獻案例解讀


21:00~2200

2節:軟件安裝

R包安裝

R簡介及R包安裝

R基礎講解

R函數

R

第二天及晚上

8:30~ 10:30

3節:組學公共數據庫

TCGA數據庫:最全的癌癥高通量數據公共庫(簡介)及數據下載

GEO數據庫的高通量數據查找、篩選、數據下載

EBI數據庫的高通量數據查找、篩選、數據下載

GEO2R工具使用

10:45~12:00


4節:轉錄組差異基因篩選及功能富集分析

計算差異基因 -R limma Excel公式

主成分分析(PCA)圖制作

聚類熱圖(heatmap)的制作——R pheatmap

火山圖(volcanoPlot)——R ggplot2 Excel制作

箱式圖(代碼 或無代碼制作)

R clusterProfiler包富集分析

基因/蛋白功能富集分析——DAVID工具

功能富集分析 柱狀圖、條形圖、氣泡圖、餅狀圖的R代碼及Excel制作

13:30~17:30

5節:多組學數據與臨床預后分析

基因突變分析工具——cbioportal

在線預后分析工具——Ualcan

本地生成KM曲線圖——R survival

相關性分析及散點圖制作

19:00~22:00

6節:轉錄組與蛋白組整合分析

Venn 圖制作

蛋白與蛋白互作關系預測——STRING工具

網絡圖構建與美化——cytoscape軟件

轉錄組與蛋白組整合關聯分析思路文章實現

第三天

8:30~10:00

7節:蛋白組與代謝組整合分析

代謝物功能富集分析——metaboanalyst工具

KEGG 數據庫介紹及使用

pathway map制作

蛋白組與代謝組整合分析思路文章實現

10:15~12:00

8節:全轉錄組整合分析

各類RNA簡介及ceRNA介紹

miRNA測序報告解讀

circRNA測序報告解讀

miRNA分析工具

lncRNA分析工具

13:30~15:30

9節:其他組學整合思路

腸道菌群宏基因組與代謝組

表觀組與轉錄組整合

15:45-16:00

總結

總結及答疑



通過本次研討會,您將學會以下作圖:

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 通路富集分析結果圖

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 聚類熱圖分析


多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 網絡圖


多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 pathway map

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 關鍵基因的KM生存曲線圖

多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 柱狀圖與venn


多組學數據整合挖掘與分析(網絡)研討會2024年

示例圖 相關性散點圖


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會議日程


即將更新,敬請期待

會議嘉賓


即將更新,敬請期待

參會指南

會議門票


票種名稱 價格 原價 票價說明
會務費 ¥3200

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溫馨提示
酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

標簽: 多組學

會議支持:

  • 會員折扣
    該會議支持會員折扣
    具體折扣標準請參見plus會員頁面
  • 會員返積分
    每消費1元累積1個會員積分。
    僅PC站支持。
  • 會員積分抵現
    根據會員等級的不同,每抵用1元可使用的積分也不一樣,具體可參見PLUS會員頁面。 僅PC站支持。

部分參會單位

主辦方沒有公開參會單位

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